Kelas Pemerintahan Desa adalah program unggulan atau COE dari Prodi Ilmu Pemerintahan yang didesain untuk menjawab kebutuhan masyarakat akan sumber daya manusia yang terampil dalam bidang Pemerintahan Desa. Kelas ini didesai dengan melibatkan banyak mitra mulai dari perencanaan, pelaksanaan dan evaluasi. Harapnya mahasiswa atau peserta yang telah mengikuti kelas COE ini dapat terserap langsung oleh mitra yang telah bekerjasama dengan program studi. Pelaksanaan kelas ini berlangsung selama dua semester dengan mekanisme semester pertama adalah materi atau Pembekalan mengenai konsep dari praktisi/mitra. Semester kedua peserta akan melalukan magang COE di tempat mitra. Mitra dalam pelaksanaan COE ini adalah Pemerintah Kota Batu, Pemerintah Kota Malang, Pemerintah Kabupaten Malang, Pemerintah Kabupaten Magetam, Kementerian Dalam Negeri.